Il mio preside sostiene che c'è incompatibilità tra l'incarico di funzione strumentale e l'insegnamento in un progetto presentato dalla stessa funzione strumentale e fa riferimento ad una fantomatica circolare.Vorrei avere notizie precise.

Non c'è nessuna fantomatica circolare. 
Il contratto 2003 prevede solo l'incompatibilità del compenso di funzione strumentale con il compenso come collaboratore del Dirigente Scolastico (art. 86 c. 2 lett. e) e fa divieto ad avere l'esonero totale dall'insegnamento come conseguenza di tale incarico (art. 30 c. 2). Tutto il resto attiene all'autonomia del collegio nella scelta delle attività e progetti da attivare e all’autonomia della contrattazione rispetto ai criteri di utilizzazione del personale nella attività retribuite con il fondo (art. 6 c. 2 lett.f).